Герметичные двери запирались, затем санитар в маске открыл вентиляционное отверстие на крыше газовой камеры и засыпал гранулы «Циклона Б», которые немедленно начинали выделять смертоносный газ. Через пять-двадцать минут, в зависимости от погоды, все внутри были мертвы от удушья. После того как выяснялось, что все погибли, ядовитый воздух откачивали, что занимало ещё около 15 минут.
Как только можно было безопасно войти внутрь, дверь открывали, и специальное подразделение заключенных, известное как зондеркоманда, шестами с крюками вытаскивало трупы и обмывало газовую камеру из шланга. С трупов снимали украшения и выдирали золотые зубы, затем тела отправили в крематории.